
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化淡化球蛋白组学产品,实现1000+玄妙度掩盖位点检测,稳定性高初现径典靶点,全地方生信浅析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“出现 ”到“认证”全环节服务于,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、实验英文的流程
02、试验数据报告
03、经“点”再次出现
在测评统计数据中,验出另的医学文献中有关资料的精品靶点以至于衣康酸淡化位点,如1、个被显示的衣康酸共价淡化球球蛋清KEAP1,再有糖酵解环路中的3个重点点酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,甚至炎性小体組成球球蛋清NLRP3和神经元烂掉过程中中的重点点球球蛋清RIPK3等,其质谱图有以下几点图如图是。
04、商品优点
1.强有力的加密管控质控
商业圈化特喜欢的人探头孵育、SDS-PAGE测量、WB查证、子样本想关性定性分析等各地方测量,确保安全工程项目没想到可信度性。2.高特性质谱器材渠道
在Orbitrap Astral全第三代人高鉴别质谱仪支持下,实现了衣康碱化体现位点及蛋白质司法鉴定新强度,动力科学实验研发新找到。3.全具体流程一坐式产品
系统设计拜谱动物逐步完善的调查网上平台,可提供了“组织细胞养育→电极孵育→WB检查测量→玄之又玄度衣康碱化突显检查测量→炫舞心悦生信研究分析→某个位点PRM印证”全标准流程工作,省时省时更可靠。05、阐述玩法(个部分)
06、应该用大方向
PART 2、论文参考文献分享图片
期刊论文一
英语翻译小标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
中文翻译题目:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
探析方面:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
文献资料二
日语微信标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
中文版主题词:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
研究分析信息:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、例案具象化基本思路
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13具备着极强的底物根据力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱海洋生物衣康硝化作用装饰组场地实测数据文件中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应掩盖(给出图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱总结ppt
当作TCA循环往复中的里面排泄转化物,衣康酸调结排泄转化、天然免疫性性和支原体感染内的互不功用,为缓解天然免疫性性支原体感染性急病出示了代替品缓解原则。衣康酸构造中的亲电性α,β-不过剩羧酸构造能对蛋清质上的吸附性半胱氨酸残基完成烷基化体现(迈克尔暴击伤害想法),该反译后体现被喻为“衣康酸体现(itaconation)”,于是印象蛋清质功能模块,干预天然免疫性性回复和排泄转化前提条件,为多种多样急病药品研发项目管理出示新总体目标。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用掩盖蛋白质组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物中医学绝对性化学发光法靶向药物细胞代谢组(QMT1000)或能力基础分泌靶向治疗基础分泌组好产品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
规范文献综述
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.