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拜谱新品发布| 免疫肽组,基于质谱的新生抗原鉴定与筛选

发布时间:2024-09-26
T体血受损上皮血人体人体受损细胞可能鉴别恶性恶性肿瘤体血受损上皮血人体人体受损细胞外壁的一般组识混溶性和好体(MHC)呈递的抗原而触及天然免疫性抗体反响。MHC I类(MHC-I)原子结构与CD8+ T体血受损上皮血人体人体受损细胞彼此之间效果,其呈递的肽一般特征于内源性胞质蛋清质的蛋清质酶体可生物降解,而MHC II类(MHC-II)原子结构一般表达方法于正规抗原提呈体血受损上皮血人体人体受损细胞,与CD4+ T体血受损上皮血人体人体受损细胞彼此之间效果,其呈递的肽源于能 内体条件可生物降解的胞外和胞内蛋清质(图1)。往往,鉴别由MHC原子结构呈递的恶性恶性肿瘤抗原针对制定根据T体血受损上皮血人体人体受损细胞鉴别和消灭掉恶性恶性肿瘤体血受损上皮血人体人体受损细胞的很好和的安全的恶性恶性肿瘤天然免疫性抗体辽法是至关根本的。针对质谱(MS)的天然免疫性抗体肽组学(Immunopeptidomics)可能从不同体血受损上皮血人体人体受损细胞系、恶性恶性肿瘤组识和健康的组识中高通骁龙量、会直接检测MHC紧密结合肽。

拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC表面抗原含有MHC极其切合肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫力肽编码序列甚至泰语翻译后表达图片信息,提高基因测序的真实度,并采用De novo上上下下测序技术应用,不依赖现有数据库,更多通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且丰富多样的数据表格阐述介绍为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!

图1 MHC-I和MHC-II呈递肉瘤抗原的有效途径

(图源:Xie et al.Signal Transduction Targeted Ther. 2023)

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案例剖析剖析

01 考核机制科学研究

文章标题主题:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells

投稿杂志社:Science Advances IF:11.7 2024

XPO1 (Exportin-1/CRM1)是种核输送淀粉酶,在胃癌中时不时过表达爱,逐项为肿癌引发的驱程缘由。近些年,靶向治疗XPO1的小大分子正被当做临床检验抗肿瘤药剂。

作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫系统肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。

图2 1种来自XPO1的肽是KIR2DS2的配体

(图源:Blunt, Matthew D et al.,Sci Adv. 2024)

02 肉瘤-天然免疫治療

好文章主题:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors

文章发表期刊:Nature Communications IF:16.6 2023

梭形细胞膜癌证胸膜间皮瘤(MPM)就就是种效果欠佳的肉瘤样癌性癌证。伴随目前有的方法方案怎么写短缺明确疗效,故而急迫须得新的方法方案。因为其T细胞膜浸泡,小说家假定MPM就就是个最合适的方法性癌证预苗的制定目标。

迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用立于质谱的免疫性肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。

图3 恶意胸膜间皮瘤免疫力肽组学查重

(图源:Chiaro, Jacopo et al.,Nat Commun. 2023)

03 沙门氏菌mRNA预防针发掘

本文试题:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes

撤稿杂质:Nature Communications IF:16.6 2023

单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过对于质谱的免疫力肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。

图4 在李斯特菌感化的Hela组织膜和HCT-116组织膜中判定MHC I呈递的抗原肽。

(图源:Mayer, Rupert L et al.,Nat Commun. 2022)

拜谱总结

免疫力检测肿瘤内部力抗体細胞細胞肽组学是球蛋白酶组学的另一个尽快不断发展的支系,它用心打造于实验免疫力检测肿瘤内部力抗体細胞細胞设备中由关键进行相融性复合材料体(MHC)或人类白細胞抗原(HLA)团伙呈递的免疫力检测肿瘤内部力抗体細胞細胞肽。许多免疫力检测肿瘤内部力抗体細胞細胞肽是細胞外观呈递的肽段,能被T細胞分辨,为了勾起免疫力检测肿瘤内部力抗体細胞細胞不良反应。通过质谱的免疫力检测肿瘤内部力抗体細胞細胞肽组学就已作为司法判定MHC球蛋白酶呈递肽的金规则的方式,能真接司法判定其他生物学和方面的问题情形下其他进行和細胞类型、中的免疫力检测肿瘤内部力抗体細胞細胞肽组,列如 线下瘤或病毒样本感染支原体的細胞。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的蛋白质组学、分解组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免役肽组验测服务管理,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,是可以为准且同时提高免疫抗体力肽队列,看到更好地非具代表性免疫抗体力肽,逐一建立出靠谱新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。

分类医学文献

1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y
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