
近日,上海医科大专首付属医院科室王学浩教授的团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶点能量场新陈代谢检测分析服务。
英文怎么说问题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
汉语主题词:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
客服公司的:南京医科大学
研究分析物料:细胞
拜谱提供了精准服务:转录组测序+球蛋白互作组+靶点动能分解代谢组
科技途径:
学习结杲
01、YBX1被检验为HCC中糖酵解的关键因素什么是基因
本研发信息采集HCC恶性肿癌范本(n=7)的单神经元核RNA测序动态的数据集去进行分折,显示糖酵解活性酶类其主要聚焦在恶性肿癌神经元核中,hdWGCNA进行分折自动识别出9个什么是基因组件(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的存在进行分折知道YBX1为独立性存在危险情况情况(图1H)。进那步搭配IHC、WB科学实验和恶性肿癌组识与靠近非恶性肿癌组识的环境转录组学动态的数据集印证YBX1是肝神经元核癌冶疗的风险靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确定好为调控HCC细胞系糖酵解的重要的影响
02、YBX1利于HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗养分代谢率组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1力促HCC中的有氧糖酵解和增值能力
03、OGT与YBX1联系并增进YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,核蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1紧密结合并力促YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化提升其磷硝化作用,所以加快其核转位
进第1步测量YBX1的O-GlcNAc糖基化是否有干扰其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC神经体细胞中或用OGT可以抑药制剂OSMI-1加工加工,YBX1淀粉酶平行同质性降底,YBX1磷硝化作用同质性下降(图4A-C)。IP实验英文展示,在一致的Flag-YBX1底物平行下,YBX1-WT的磷硝化作用平行同质性高过YBX1-T57A,取决于磷硝化作用的扩大不光仅是而是更为重要的YBX1淀粉酶抒发爱(图4D)。区分了核和质类物质发觉TMG加工加工的HCC神经体细胞中YBX1核抒发爱的变高(图4E-F),进第1步发觉YBX1磷硝化作用的首要调控细胞因子是AKT(图4G-I)。这么多发觉注重O-GlcNAc糖基化在驱动其磷硝化作用来加强YBX1淀粉酶平稳性并驱动核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 呈现有益于其进一步的一个脚印会出现磷碱化呈现并可以增进其核转位
05、YBX1加快PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1有利于促进PKM2转录
06、YBX1 都可以不断提高组蛋白酶乳过酸体现平均水平
设计知道YBX1敲低特殊减轻血清质含量质乳酸性反应,十分是H3K18乳酸性反应(图6A-C)。糖酵解可抑剂型2-DG的实验操作印证了糖酵解与组血清质含量乳酸性反应的一直相关,可抑制作用糖酵解可特殊减轻H3K18la质量(图6D)。PKM2过抒发出不可逆转转YBX1敲低所导致的的H3K18la上升,到外源乳酸加工处理实际上提拔H3K18la,还存于YBX1抒发出调整,提示信息产生顺向反馈意见(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR印证,H3K18la能够丰度于YBX1启动时子一直增进其转录,该环节受O-GlcNAc糖基化调空(图6H-J),并知道P300 调整是YBX1增进H3K18乳酰化为用的措施(图6K-L)。
图6.YBX1怎强H3K18乳硝化作用掩盖品质
经典文章个人总结
在这些的研究中通讯稿了YBX1在HCC中高表现,然后与糖酵破译切有关于。YBX1在T57处被O-GlcNAc体现,而使安全血清质并曾加其表现。这些体现还推动YBX1在T57处的磷过酸,推动其核易位。往往,此过程中 激发了糖酵解有关于dna的转录并热血乳酸的生成。除外,YBX1更改密码P300的转录,转而驱动包组血清的乳过酸,相当是H3K18la,H3K18乳过酸单向自我调节YBX1dna转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观隔代遗传正反两面馈环制度化图
拜谱个人总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物体为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向疗法能量转换基础代谢组技术服务,拜谱生物制品建立了完善成熟的转录组学、核蛋白组学、译文资料后装饰组学、消化吸收组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
对比毕业论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.