代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
物质检测：分解代谢率组学工艺能对中草药中的生物学物质采取详细概述，检测出中医材中的渗透性物质。这类，灵活运用依托于质谱（MS）的分解代谢率组学工艺，也都可以检测出高丽参中的高丽参皂苷等渗透性物质。这些工艺还也都可以辩别中医和非中医部份的生物学箭头物，为中草药的产品品质管控提高意义。
产品把控好：经过产生组学水平，是能否对成药的产品做出评价和把控好。举例，凭借观赏动植物产生组学解析，是能否建设根据类风湿骨痛性软骨炎的成药含量的产品标示的一定量手段。还有就是，产生组学还是能否设别成药中的渗透性含量基本渗透性机理，如经过UPLC-Q-TOF-MS探析，辨认其他乌头观赏动植物的化学式含量，并设别拥有镇疼几丁质酶和突然渗透性的动物碱。
2. 中药药效机制研究
功能靶点掌握：细胞代谢组学系统可以幫助掌握中葯活性氧组成成分的原子核靶点。比如说，探讨察觉到雷公藤红素可进行改善Treg/TH1和Treg/Th17发展、阻隔NF-κB环路等系统推动抗感染功能。
功用机能诠释：排泄转化组学的技术能够蕴含中要治療皮肤疾病的功用机能。举个例子，论述看到青蒿素抗药与疟原虫的线粒体排泄转化更改相关的，非靶向治疗排泄转化组学蕴含了与该整个过程相关的排泄转化物变幻。显然，排泄转化组学还能能凭借定量分析排泄转化物的变幻，论述中要复方的功用机能。
3. 中药安全性评价
致毒策略研发：基础消化吸收率组学科技能能采用研发中药材的致毒策略。举个例子，经过基础消化吸收率组学和16S rDNA测序的兼容合并阐述，阐释了清益汤对危重症猛然膀胱胰腺炎对应猛然膀胱肺影响的保障策略，并确实了铁处变不惊、区别基础消化吸收率物和微生态学菌群互相的相互影响。
可靠性监测：基础代谢组学水平还也可以操作中葯的可靠性监测，识别系统隐藏的的致毒的成分和致毒靶点，可以为中葯的可靠操作能提供生物学根据。
4. 中医证候研究
证候有关系消化吸收物钻研：消化吸收组学技術行应用于表现与医学证候有关系的内源性消化吸收物波动，辅助性医学证候的测试和行为矫正。譬如，借助消化吸收组学钻研，已在冠相思病人中亲子鉴定出与痰瘀证和和气气阴两虚证有关系的怪物标记物。
证候矫治定量分析：代谢率转化组学工艺还不错使用在定量分析中国传统医学对中国传统医学证候的矫治效用。诸如，使用代谢率转化组学工艺及聚类算法定量分析法，发展“黄芪-茯苓-泽泻”等微信关联性肿瘤药物选择装配适使用在肾病结合征的新组方性肿瘤药物，能够对多类肾病结合征有关的的生态学标记物引发影向。
5. 多组学技术整合应用
两组学聚合：产生组学与相关组学枝术（如遗传基因组学、转录组学、蛋清质组学等）的聚合APP，为药材材材钻研打造了个多空间维度的阐述体系结构。此种聚合APP并不是显现了咱们对药材材材材质在碳原子层面上上对躯干生理变化和病症壮态的效果，另一方面为反映药材材材的效果系统和效果物料地基打造了强力量的的工具。
慢性病诊疗长效系统：几组学能力需要使用在科研中药方诊疗慢性病的分子式长效系统。列如 ，采用血清质组学和基础基础代谢组学的联席拜谱生物，表明了与中医学类型的膝依然能骨性依然能炎增进相应的对比分析形容血清和基础基础代谢信号通路。
代谢转化组学技巧在草药理论研究中的应用，为草药的现化化和精准性的医学展示了重要性的专业苹果支持，有助持续推进草药的准则化和新全球化成长。