
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱动物 为其提供 TMT淀粉酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
理论研究最后
学习拜谱生物来探寻跟着食品保鲜时间间隔段提高牛羊肉的硬性、持反击式水轮机、色调、存在铁占比、ROS、脂质过防氮化合物、MDA、GSH和GPX4程度来评估报告格式肌肉群组织安排受损细胞核的铁窒息死亡阶段。最后提示,食品保鲜时间间隔段提高后,牛羊肉的硬性在第8天和第6天明显增涨;持水工作能力大幅度降低;彩色变深,消失凹凸感,鲜鲜红色的转变成暗鲜红色的。与此同时,存在铁、可溶性氧和MDA的占比明显加入,受损细胞核凋亡率明显上升。 设计人分离出来区别冷藏箱精力的腿部手臂肌肉图纸的核血清质含量,以后对其进行SDS-PAGE定量进行分析,核血清质含量条带在区别时间分布点透亮且相类似(图1a)。表明核血清在区别图纸中的表答情況,定量进行分析出现相同组图纸的中个数比较敏感于相同技术(图1b),原因分析腿部手臂肌肉图纸核血清质含量具备较好的组内相类似性和组间之间的关系性。 蛋清质组学共评定出1996种蛋清质。以B0为参考组,需求B1、B2、B4和B6中的蛋清来相互影响展示定量进行分析,共评定到374个DEPs。将火山图数据可视化,并基于FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两个标准单位定量进行分析DEP。数据图甲1c-f一样,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别评定出22、33、73和140个DEPs,中仅分刘海别调涨6、11、32和83个,上涨16、22、41和5两个。聚类分析方式 评估报告了不一样冷藏库阶段中,胸肌组织性中蛋清质的展示,数据屏幕上显示胸肌蛋清展示相互影响伴随着储藏的时间的提升而提升(图1g)。
图1| 各种保温时段的力量土样蛋白酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各种不同食品冷藏时的脂肪试样之间的关系蛋白质剖析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁自杀核蛋白肽的PRM一定量定性分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 依据KEGG生物富集的差异表明蛋白酶的铁消亡机能(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物体提供了TMT酶联免疫法膳食纤维质组学技術的产品,拜谱生物工程已研发项目管理完工并建立联系了不断完善完善的转录组学、膳食纤维组学、消化吸收组学或者几组学联手的产品技術的产品工作体系,欢迎致电咨询!
对比论文文献综述:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.